1.根本區別

柱前衍生：在分析物經過色譜柱前與衍生劑反應，反應產物在色譜柱上實現分離，實際分離的是衍生產物，檢測的也是衍生產物。

柱后衍生：分析物在色譜柱中實現分離后，在衍生池內與衍生劑反應，檢測的是衍生產物。

2.優點

柱前衍生：

（1）相對自由地選擇反應條件。

（2）不存在反應動力學的限制。

（3）衍生副產物可進行預處理。

（4）容易允許多步反應的進行。

（5）有較多的衍生劑可選擇。

（6）不需要復雜的儀器設備。

柱后衍生：

（1）重現性好，影響因素少，引入物質比較少。

（2）分析物可以在其原有的形式下進行分離，容易選用已有的分析方法。

3.缺點

柱前衍生：

（1）形成的衍生副產物可能對色譜分離造成較大困難。

（2）在衍生化過程中，容易引入雜質，或損失樣品。

柱后衍生：

（1）對于一定的溶劑和有限的反應時間來說，目前只有有限的反應可供選擇。

（2）可能有擴散問題。

（3）需要額外的儀器設備。